# RGD-PIPELINE: ftp-file-extracts # MODULE: markers build 2021-04-30 # GENERATED-ON: 2024/11/29 # PURPOSE: information about active Mouse markers extracted from RGD database # CONTACT: rgd.developers@mcw.edu # FORMAT: tab delimited text # NOTES: multiple values in a single column are separated by ';' # # Where a marker has multiple positions for a single map/assembly # (f.e. D1Arb36 has positions 78134192..78134522 and 78153000..78153323 on ref assembly) # is how it is presented in the columns CHROMOSOME_3.4, START_POS_3.4 and STOP_POS_3.4: # 1;1 78134192;78153000 78134522;78153323 # ### Apr 1, 2011 RATMAP_IDs and RHDB_IDs are discontinued. ### Jul 1, 2011 fixed generation of UNCURATED_REF_PUBMED_IDs. ### Nov 23, 2011 no format changes (UniGene Ids are extracted from db in different way). ### Dec 19 2011 no data changes; improved internal QC. ### May 31 2012 no data changes; (optimized retrieval of maps data from database) ### Oct 22 2012 fixed export of positional information for mouse (positions on assembly build 38 were exported as positions on assembly 37). ### Nov 20 2012 rat: positions on assembly map 3.1 are no longer exported; instead position on assembly 5.0 are exported. ### Dec 26 2013 no data changes; improved internal QC. ### Sep 8 2014 rat: available positions on assembly Rnor_6.0. ### Oct 29 2018 discontinued columns #8 CLONE_SEQ_RGD_ID and #10 PRIMER_SEQ_RGD_ID. Column #8 now shows marker type. ### Nov 1 2018 renamed columns SSLP_RGD_ID => MARKER_RGD_ID, SSLP_SYMBOL => MARKER_SYMBOL, SSLP_TYPE => MARKER_TYPE. ### Jun 17 2019 data sorted by RGD ID; files exported into species specific directories ### Jan 19 2021 discontinued column 15 with UniGene IDs ### Apr 30 2021 added export of positions for new rat assembly mRatBN7.2 # #COLUMN INFORMATION: # (First 23 columns are in common between rat, mouse and human) # #1 MARKER_RGD_ID RGD_ID of the marker #2 SPECIES species name #3 MARKER_SYMBOL marker symbol #4 EXPECTED_SIZE marker expected size (PCR product size) #5 CURATED_REF_RGD_ID RGD_ID of paper(s) about marker #6 CURATED_REF_PUBMED_ID PUBMED_ID of paper(s) about marker #7 UNCURATED_REF_PUBMED_ID other PUBMED_IDs #8 MARKER_TYPE marker type, if available #9 CLONE_SEQUENCE clone sequence itself #10 (UNUSED) #11 FORWARD_SEQ forward sequence #12 REVERSE_SEQ reverse sequence #13 UNISTS_ID UniSTS ID #14 GENBANK_NUCLEOTIDE GenBank Nucleotide ID(s) #15 (UNUSED) #16 ALIAS_VALUE known aliases for this marker #17 ASSOCIATED_GENE_RGD_ID RGD_IDs for gene associated with this marker #18 ASSOCIATED_GENE_SYMBOL symbol for gene associated with this marker #19 CHROMOSOME chromosome #20 FISH_BAND fish band #21 CHROMOSOME_CELERA chromosome for Celera assembly #22 START_POS_CELERA start position for Celera assembly #23 STOP_POS_CELERA stop position for Celera assembly #24 CHROMOSOME_37 chromosome for the current reference assembly v.37 #25 START_POS_37 start position for current reference assembly v.37 #26 STOP_POS_37 stop position for current reference assembly v.37 #27 (UNUSED) #28 (UNUSED) #29 (UNUSED) #30 MGD_ID MGD ID #31 CM_POS mouse cM map absolute position # MARKER_RGD_ID SPECIES MARKER_SYMBOL EXPECTED_SIZE CURATED_REF_RGD_ID CURATED_REF_PUBMED_ID UNCURATED_REF_PUBMED_ID MARKER_TYPE CLONE_SEQUENCE (UNUSED) FORWARD_SEQ REVERSE_SEQ UNISTS_ID GENBANK_NUCLEOTIDE (UNUSED) ALIAS_VALUE ASSOCIATED_GENE_RGD_ID ASSOCIATED_GENE_SYMBOL CHROMOSOME FISH_BAND CHROMOSOME_CELERA START_POS_CELERA STOP_POS_CELERA CHROMOSOME_37 START_POS_37 STOP_POS_37 (UNUSED) (UNUSED) (UNUSED) MGD_ID CM_POS 4892674 mouse D2Dcr36 222 4890412 CCCTCCAATACTTCACCAGC TTATCTCGTGAGCGGTATCG 2 MGI:1333183 67.35 4892680 mouse D11Sac27 221 4890412 CCTAAGAGAAGAAAATGTGGAATCA TGTCTATGGAGGCACAGGTTC G31430;XM_887141;XM_910045;AL645907;GL591102 2295123 Msantd5 11 B1.3 11 55794776 55794995 11 51048513 51048732 4892682 mouse G36434 120 4890412 CCTAGCGCAGCCATGGTAAG CCTCCACCCTGTAGTCGACC G36434;AL954850;GL591110 RPS4X-mou 737146 Rps4x X D X 89101209 89101328 X 99384532 99384651 39.0 4892685 mouse G48132 85 4890412 CCTCATGGAACTGATTTCCAG ATTCAACCCTGGCTTTGGTG G48132 sMSS33 4892688 mouse U23916 160 4890412 CCTCGCGTTTGCGCACATCC CGTGGTGACGTATCGAACAAA U23916 MMU23916 4892690 mouse G36384 142 4890412 CCTCCTTGCATCTCTAAGTGC GTAGTGGGTGATCTAAGCCTC G36384;AL928699;AC121931 19R 1616796 Map3k20 2 C3 2 74047384 74047525 2 72201120 72201261 4892693 mouse Z72371 115 4890412 CCTGGATGTAGTGAAGATTCC AACGACGGCCAGTCTCATC Z72371 MMD6BHM17 4892695 mouse D17S589 196 4890412 CCTGGCAACTGACTTTGATCCTT TCAGTTCCTCTCTGAAGAACTTAC L29808;AC166169;AC154754 1318253 Rcbtb1 14 C3 14 57034790 57034989 14 59849754 59849949 4892751 mouse Ampd1 124 4890412 TTTCCTCCAAGAGTCCCAAA ATGCCTCGTTCCTTTCTCAG NM_001033303 10154 Ampd1 3 F2.2 3 105295112 105296245 3 102894049 102895182 MGI:3778418 48.5 4892753 mouse Hcrtr1 97 4890412 GCTCAAGAAAGCAGTGTTGCAA AGGGTGAAGTGACACTCTAGGGTAGA NM_001163027;NM_198959;BC119583;BC119582;AY336083;AL606925;CU207372;BV021289;GL589708 UniSTS:496028;UniSTS:464624;UniSTS:464625 737545 Hcrtr1 4 D2.2 4 128465042 128465138 4 129807811 129807907 MGI:3625336 4892756 mouse Hcrtr2 1408 4890412 GAGACAAGCTTGCAGCACTGAG TGAGTCGGGTATCCTCATCATAG AY336084 UniSTS:464629 1553616 Hcrtr2 9 D 9 73394637 73394851 9 76078273 76078487 MGI:3505867 4892766 mouse Adamts19 675 4890412 AAGATCTCTGCCAAAGGTCCCACA TCGCCACACGTAGCATTTGGAGTA NM_175506;BC150736;AY135183 1318083 Adamts19 18 D3 MGI:5002553 4892768 mouse Aard 118 4890412 CATGAAAATGCAGCAGCTGAA GCCTCGGACTCTCCACTATGC NM_175503;FI111709;ET200805;ER986548;ER884404;EI392477;BC089505;CW916934;CW509158;CL632055;AY134665;AC160550;AC022775;CL458945;GL589645 UniSTS:464651;UniSTS:256995 736762 Aard 15 C 15 53618036 53618153 15 51876399 51876516 MGI:3510922 4892770 mouse Amh 204 4890412 CTATTTGGTGCTAACCGTGGACTT AAGGCTTGCAGCTGATCGAT NM_007445;BC150477;BC150154;AY911505;AC166937;AC152413;X83733;BV159400;BV096422;X63240;GL591122 UniSTS:496634;UniSTS:464653;UniSTS:265566;UniSTS:275862 10152 Amh 10 C1 10 81824740 81824943 10 80269115 80269318 MGI:3510924 43.0 4892772 mouse Bmp2 176 4890412 AAGCGTCAAGCCAAACACAAA GAGTTCAGGTGGTCAGCAAGG BC100344;AL831753;L25602;GL590591;NM_007553 UniSTS:496639;UniSTS:478949;UniSTS:464654 735602 Bmp2 2 F2 2 134783077 134783252 2;2;2;2;2 133386912;133380171;133386850;133386239;133386821 133387036;133380419;133387090;133386522;133387275 MGI:4938622 76.1 4892774 mouse Cbln1 189 4890412 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1557652 Hoxa3 6 B3 6 52693793 52694251 6 52122129 52122587 MGI:5292682 26.3 4893206 mouse Hoxa6 68 4890412 CCTATTTTGTGAATCCCACTTTCC CAGCTGGCCCAAGAAGGA NM_010454;BC119107;BC119105;AB221546;AC015583;AC113985;AF247663;GL593127 UniSTS:467537 1615194 Hoxa6 6 B3 6;6 52728208;52729930 52728308;52730264 6;6 52156555;52158278 52156655;52158612 MGI:5292685 26.3 4893208 mouse Hoxa9 1109 4890412 CCTGGATGAAGGAGAAGAAGGC TGGTCACTTTCTTGCAGGCCTCC M95599;NM_010451 Ifnar1;UniSTS:274178;Hoxa2 731539 Hoxa2 6 B3 6;6;6;6;6;6 52746362;52745919;52746046;52745351;52748070;52745810 52746498;52747214;52747594;52745917;52748918;52747206 6;6;6;6;6;6 52174170;52173711;52176430;52174279;52174406;52174722 52175566;52174277;52177278;52175574;52175954;52174858 MGI:5307838;MGI:4411913 26.32 4893210 mouse Hoxb9 474 4890412 AAGTCACGAGAGCGAGGACGC ACTCAGATTGAGGAGTCTGGC NM_008270;AY414680;BC103573;BC100743 1314614 Hoxb9 11 D MGI:5288025 56.0 4893212 mouse Hoxd3 129 4890412 AAAGAATCCCGACAGAACTCCAA CACCAGCTGAGCACTCGTGTAC 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NM_177431;BC121792;AY189815;AJ512753 1317085 Adamts20 15 E3 MGI:5002554 44.4 4893254 mouse Ankrd17 4890412 GGTAGTTTTCTGTCAGTGG GAAGACTGTGCATTGACATC 1615004 Ankrd17 5 E2 MGI:3531458 4893257 mouse D15Jcs50 4890412 ATACAGCCCAGACTGGCCTCAAATG GCTCAGTTGGTAAATGCCTGCCG AC104325;GL592165 UniSTS:468266 15 15;15 84355352;84355244 84355496;84355496 15 82061601 82061867 MGI:3574530 48.0 4893273 mouse Cyp1b1 848 4890412 AGCTGAGCTCGCTGTCTACC GTCCGTCATGTCTCGAGGAG NM_009994;BC050063;X78445;U03283;AC132612;AC132133;GL589967 10439 Cyp1b1 17 E3 17 84024891 84025738 17 80112770 80113617 MGI:3053273 4893275 mouse Cyp2e1 357 4890412 CGCTTCGATTACGATGACAA TGTGCTGGTGGTCTCTGTTC NM_021282;BC013451;L11650;X62595;AC107815;AY407531;GL590735 UniSTS:468829 10451 Cyp2e1 7 F5 7 140561893 140563289 7 147955537 147956933 MGI:3574789 68.4 4893277 mouse Cyp2r1 361 4890412 CCATGGATTGGCATCTTACC CCCAAGAAGGTCTCCTGTTG NM_177382;BC108961;AY323818;AC156617;GL592208 UniSTS:468830 1323547 Cyp2r1 7 F1 7 114508041 114509039 7 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Raf1 348 4890412 AACCCGTTCAGCTTCCAGTC CGTGCAAGCATTGATGTCCTC NM_029780;BC092040;AB057663;BC015273;AB052739;AC160032;AC129013;GL596536 UniSTS:469819 11215 Raf1 6 C3 6;6 117458818;117474674 117459338;117475201 6;6 115584570;115568713 115585097;115569233 MGI:5285976 52.5 4893322 mouse Rps6ka1 396 4890412 CAGTGCAGACGAACTCCTCAGAGGC TCTGAGAGGCGACACTGGACCTGC BC094470;M28489 UniSTS:469820 732452 Rps6ka1 4 D3 4 132019243 132019638 MGI:3576765 4893324 mouse Sos1 322 4890412 CTAAGCTGGGATAGTTTCCTAGC CTGTCAACATATGGGCTTGTTG NM_009231;Z11574;AC161447;AY902349;GL589543 UniSTS:469822 1322141 Sos1 17 E3 17 84716117 84716438 17 80797193 80797514 MGI:3576756 44.0 4893326 mouse Rps6ka2 4890412 CACTCCACTGTGGCTCAGAA CCTTTCCTCATGTTGGGTA NM_011299;BC066063;BC055331;BC051079;BC043064;BC038251;AJ131021;AC196038;AC174679;AC166110;AC166360;AC147798;AC148610;AC118546;AC117241;AF140708;AF140707;BC056946;CH466693 1550581 Rps6ka2 17 F4 MGI:5296795;MGI:3723979 7.6 4893331 mouse Figf 425 4890412 GAAGAATGGCAGAGGACCCA 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1610911 Rplp0 5 F MGI:3578304 4893355 mouse Cdkn1c 109 4890412 CAGGACGAGAATCAAGAGC AGAAGTCGTTCGCATTGG NM_001161624;NM_009876;BC005412;U20553;U22399 UniSTS:470552;UniSTS:265486 1322981 Cdkn1c 7 F5 7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;7 143214920;143215551;143214216;143214931;143215798;143214123;143214470;143215742;143214530;143215552;143214919 143215569;143216170;143214948;143215934;143216585;143215605;143214681;143215934;143214680;143216170;143215570 7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;7 150645750;150645118;150645941;150645119;150644415;150645997;150645130;150645751;150644669;150644729;150644322 150646369;150645769;150646133;150645768;150645147;150646784;150646133;150646369;150644880;150644879;150645804 MGI:4868818 69.49 4893360 mouse Hoxa1 81 4890412 CCTTGGCAGTGGCGACTCT GCGCAGGATTGGAAAGTTGT NM_010449;AC015583;AC091106;BC138097;BC138098;M22115;M20214;X06024;GL589650 UniSTS:470556 732851 Hoxa1 6 B3 6;6 52677099;52679535 52677412;52679756 6;6 52107893;52105457 52108114;52105770 MGI:5292680 26.28 4893362 mouse Hoxb1 501 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Neurog2 1080 4890412 TGATGCACGAGTGCAAGCGTCG ACAGCCTGCAGACAGCAATGGG NM_009718;BC055743;Y07621;AC158308;AC102600;AF303001 UniSTS:470670 1319192 Neurog2 3 H1 3 134124141 134125220 3 127336891 127337970 MGI:3723654;MGI:4411315 4893411 mouse Pax5 730 4890412 CCAGATGTAGTCCGCCAAAGG CATGTCATCCAGGCCTCCAGCC NM_008782;M97013;JX065130 1621602 Pax5 4 B1 MGI:5288010 20.7 4893413 mouse Pax2 70 4890412 AGTCTTTGAGCGTCCTTCCTATCC CATTCCCCTGTTCTGATTTGATGT NM_011037;BC148232;BC150484;AY965050;Y07617;X55781 1313674 Pax2 19 C3 MGI:3579679 43.0 4893417 mouse Pdia3 779 4890412 TGACCTGGCTCAGCAGTATG CTAAGAAGCGGTGGCAAAAC NM_011032;BC093512;BC008549;J05185;X06453 11046 P4hb 11 D-E MGI:3579776 69.0 4893419 mouse Prdx1 471 4890412 GTGGATTCTCACTTCTGTCATCT GGCTTATCTGGAATCACACCACG NM_011034;FI112046;FI111938;EI505043;EI192057;BC086648;BC083348;D21252;D16142;CT010584;AB023564;AB023566;AB023565;XM_003688864;JH801637 UniSTS:470676;Prdx1-rs1;Prdx1-rs2;Prdx1-rs3;Prdx1-rs4;Prdx1-rs5;UniSTS:259380 733745 Prdx1 4 D1 8;16 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MGI:3580713 3.0 4893434 mouse Adam9 435 4890412 GCCTGACGAAGCCTACA TTGCCAAATCTGTCACCT NM_007404;BC052710;AK122188;BC047156;U41765;NM_001270996 1321128 Adam9 8 A2 MGI:3580711 8.0 4893436 mouse Adipor1 529 4890412 TGCCCTCCTTTCGGGCTTGC GCCTTGACAAAGCCCTCAGCGATAG NM_028320;AY424290;BC014875;AY403565 UniSTS:495948 1332010 Adipor1 1 E4 1 137038778 137038871 1 136328391 136328484 MGI:3581426 4893438 mouse Adipor2 354 4890412 TCTTCCTGTGCCTGGGGATCTT CCCGATACTGAGGGGTGGCAAA NM_197985;BC064109;AY424291;BC024094;AC115816;AY410780;GL590589 1317350 Adipor2 6 F1 6 121191779 121192373 6 119308952 119309546 MGI:3581427 60.7 4893441 mouse Adrb3 363 4890412 GCAACCTGCTGGTAATCGTG CTCATGATGGGCGCAAAC AC102544;GL589922 UniSTS:471070 10110 Adrb3 8 A2-A4 8 28718222 28718584 8 28338377 28338739 MGI:3581386;MGI:3581385 10.0 4893444 mouse Adrb2 167 4890412 TCTGTCTGTCTGTCTGGATGATG CCCATTGTCACAGCAGAAAGG BC032883;BC030346;AC124430;X15643;NM_007420;GL591721 UniSTS:471069 10109 Adrb2 18 E1 18 63463029 63463195 18;18 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ATTAGTGCATAGTAGTCAGGGCTGG NM_007995;BC019180;AB007813 733071 Fcna 2 A3 MGI:3581662 4893458 mouse Fcnb 991 4890412 CTGGGATCTGCTGCACTATTCGTCT AGCTAGCAGTGAAGATGGAAGAGTC NM_010190;BC107220;BC107221 732192 Fcnb 2 A3 MGI:3581663 4893464 mouse Masp1 70 4890412 AGAATCATCGGAGGTCGCAAT TGTCTTCCACCACTATGAGGGC AB049755;AC154571;AC163612;AY135526;GL590021 1552750 Masp1 16 B2-B3 16 24029073 24029142 16 23470693 23470762 MGI:4821575 4893466 mouse Lrrc10 1376 4890412 CACTCCCTGACAGAGTTGGTG GGTAGAGTTGTCCCTTTCAGG NM_146242;AF527781;AL589661;GL591764 UniSTS:471082 1316510 Lrrc10 10 D2 10 118988526 118989901 10 116482428 116483803 MGI:3581826 4893468 mouse Masp2 668 4890412 GCTGCCTCCCAGGATTGAAACTGAC GACTTTTGTGTAGACCCCATACTGG NM_001003893;BC013893;AB009459 1553528 Masp2 4 E1 MGI:3581665 4893470 mouse Angpt2 368 4890412 GGGGAGAAGAGAAGAGAAGAG CAGGGCATTGGACATTAG NM_007426;BC138313;BC138309;BC027216;AF004326;AC129567 UniSTS:498722 1550503 Angpt2 8 A1.3 8;8 18831376;18824597 18832305;18824984 8;8 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TGGGGATAGGTAAGGGGAGAAAG NM_009235;BC119069;BC119067;AF182945;AL603707;AB039222;AB039221;AB039220;AB039219;AB039218;AB039217;AB039216;AB039215;AB039214;AB014474;GL590284 UniSTS:471101 1323789 Sox15 11 B3 11 69468982 69470060 MGI:3582522 39.0 4893498 mouse Sox13 700 4890412 CCCCACAACCACTGAACCTC GGACGCCGTGTCCTCAT AJ000740 1320145 Sox13 1 E4 MGI:3582518 4893500 mouse Sox17 920 4890412 AAGGCGAGGTGGTGGCGAGTAG CCTGGCAGTCCCGATAGTGG NM_011441;D49474;AC129937;AC116706 UniSTS:471102 1313359 Sox17 1 A1 1 4509223 4510142 1 4482435 4483354 MGI:3582520 7.0 4893502 mouse Sox18 4890412 CGAATCAGGGCGCTATGGCTTTG AGTGGGTAGCTCGCGGAAGG NM_009236;BC006612;L35032;AL844529;AF288518;GL595825 UniSTS:471103 1323322 Sox18 2 H4 2 185753141 185753737 2 181405454 181406050 MGI:3582521 96.0 4893504 mouse Sox3 184 4890412 TCTCCGCCGCCCGCCATCCGTTCG CCGTTCCATTGACCGCAGTC AF434675;X94125 UniSTS:496810 11333 Sox3 X A7.3-B X 47328337 47328452 X;X 58145936;58144890 58145996;58145005 MGI:3582515 24.5 4893506 mouse Sox2 184 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Abtb1 6 MGI:3587009 4893622 mouse Acad9 4890412 TAATACGACTCACTATAGGGCAGTGCCAACAAGCTTGAGG TAACCCTCACTAAAGGGAGCTGGTACTTCCTTCCTTCC NM_172678;BC033277;BC032213;BC031137 1331972 Acad9 3 MGI:3586828 4893624 mouse Cpne4 4890412 TAATACGACTCACTATAGGGTCCTTCGAGACATCGTCCAG TAACCCTCACTAAAGGGAAAAATCTCTCATCCTATAGGAG NM_028719;BC063081;BC043087 1551101 Cpne4 9 MGI:3586830 4893627 mouse Dicer1 101 4890412 CATTATCAAACTTTAAATTCTGCCTTC GCGGCAAGACAGCGG NM_148948;AF430845;AC124364;AK129241;BC023863;AF484523;GL589920 UniSTS:498691 1319700 Dicer1 12 E-F1 12 105921978 105922078 12 105929685 105929785 MGI:2179213 4893629 mouse Dkk1 815 4890412 CCTTCGGAGATGATGGTTGT CAGGTGTGGAGCCTAGAAG NM_010051;BC050189;AF030433;JN966751 UniSTS:498426;UniSTS:498746;UniSTS:471821 1316436 Dkk1 19 C2 19;19;19;19;19;19;19 31331741;31332230;31331867;31332266;31331118;31330804;31331909 31332220;31333477;31332220;31333268;31331312;31331312;31331970 19;19;19;19;19;19;19 30621050;30622176;30620736;30622212;30621855;30621813;30621687 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TAATACGACTCACTATAGGGCCATTGCTTTGCCCTGATAT Ago1 1312164 Ago1 4 D2.2 MGI:3587194 4893641 mouse Eif2c3 4890412 AATTAACCCTCACTAAAGGGGTCCTTCACACTATCATGTT TAATACGACTCACTATAGGGTTGTCACGGAGAATAAACTT NM_153402 Ago3 1616587 Ago3 4 D2.2 MGI:3587196 4893643 mouse Eif2c2 4890412 AATTAACCCTCACTAAAGGGTATCAGCCAGGAATCACGTT TAATACGACTCACTATAGGGGGTCAAGCAAAGTACATGGT AC161171;AC116671;NM_153178;BC129922;BC128379;BC096465;AK220193;BC064741;BC056639;AB081472;BC024857;CM000996;GL456100;CH466532;GL589461 Ago2;UniSTS:479102 732768 Ago2 15 D3 3 142473636 142474323 3 135712774 135713461 MGI:3587195 4893645 mouse Eif2c4 4890412 AATTAACCCTCACTAAAGGGCCTCTGTAGTCATGCAGGAA TAATACGACTCACTATAGGGGAGGATACGTGAGATGCCAA Ago4 1312106 Ago4 4 D2.2 MGI:3587197 4893648 mouse Gpr175 4890412 TAATACGACTCACTATAGGGCAGCTGAGGATTTCAACATC TAACCCTCACTAAAGGGATCCCACACTAGAGCACAGG Tpra1 1618402 Tpra1 6 MGI:3586827 4893650 mouse Frzb 947 4890412 ATGAAACTCCGACACCTTGG CCAATACCAGCAAGCCAAAT NM_011356;BC016884;U88568;U68058;AL928578 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24941665;24943964;24941665 8;8;8 24556800;24556798;24559804 24557756;24557756;24560049 MGI:4357890 9.5 4893672 mouse Sfrp2 4890412 GAAGATCTATGCCGCGGGGCCCTGCCTCG CTGGATCCCTAGCATTGCAGCTTGCGGAT NM_009144;BC014722;AF017989;U88567;D50462;AC133160;AC141473;AY403250;CM000996;GL456099;CH466547 UniSTS:471844 1550582 Sfrp2 3 E3 3 83785780 83785921 3 83577093 83577234 MGI:4357891 38.5 4893675 mouse Sfrp4 500 4890412 CACCACAGCACTCAGGAGAA TCATTGCAACCACTCCTCTG NM_016687;BC034853;AF117709 731352 Sfrp4 13 A2 MGI:4367863 7.0 4893677 mouse Sfrp5 1158 4890412 GATCTGTGCCCAGTGTGAGA TTCAGCTGCCCCATAGAAA NM_018780;BC032921;AF117759;AY410885;AC119236;AL603804;GL589488 1321236 Sfrp5 19 D1 19 42996608 42997765 19 42273184 42274341 MGI:5296803;MGI:3723981 4893679 mouse St14 82 4890412 AGGGCAACCCTGAGTGTGAT AAGGATCGCAGCCCACAGT NM_011176;BC005496;AF042822;CT025653;AC114542;AY419858 UniSTS:495857 733375 St14 9 A4 9 28354904 28355738 9 30903288 30904122 MGI:4821579 17.0 4893682 mouse Trh 595 4890412 TAATACGACTCACTATAGGGTCTTGGAAAGCTCTGCAGAG TAACCCTCACTAAAGGGACCAGGATGCTGACGTTTCTC NM_009426;BC053493;X59387;AC164642;CM000999;GL456132;CH466523;GL589656 11452 Trh 6 D1 6;6 94138017;94138017 94139331;94138458 6;6 92192400;92192400 92193717;92192841 MGI:3586832 40.0 4893685 mouse Tspyl2 1100 4890412 GGCCGGTTGGTGTCTATTCTA CACTGCCCTCATTGTCCCCCTCAT AL731727 UniSTS:471851 1557059 Tspyl2 X F2 X 148773451 148774550 MGI:3587115 64.0 4893687 mouse Wif1 4890412 AAAAAAGCGGCCGCGCAGCCAAGGCGAGAACTT ACGCGTCGACGCTGTGAACCCGGTGTAAC NM_011915;BC013268;AF122923;AC153357;AC140381;AY410744;BC004048;CM001003;GL456156;CH466578;GL592865 UniSTS:471852 1552191 Wif1 10 D2 10 123399374 123399971 10 120471489 120472107 MGI:4357851 4893690 mouse Wnt16 308 4890412 CCGATGTCCACACGTGTAAGT TGCTTCAGAAACAGATTTGATGT NM_053116;AC115039;GL590419 1558269 Wnt16 6 A3 6 22352331 22352638 6 22248209 22248516 MGI:4367850 4893692 mouse Zxdc 4890412 TAATACGACTCACTATAGGGCAGATGATTCACAGGCCATG TAACCCTCACTAAAGGGAGCTCTTCTAGGACTTGTCAC 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