# genes having position on rat assembly UTH_Shr, # but not having position on assembly rn7 # generated on: Oct 05, 2022 # count of genes in the file: 199 # RGD_ID GENE_SYMBOL GENE_TYPE CHROMOSOME START_POS STOP_POS 1311153 Ankrd45 protein-coding 13 76017241 76042944 620896 Cd99l2 protein-coding 15 6563091 6608585 1563539 Ceacam18 protein-coding 1 99456472 99471084 621780 Dkc1 protein-coding Y 2037843 2053706 1593284 Hspa1a protein-coding 20 4554562 4558670 1359286 Iqcm protein-coding 19 13697839 13852610 2322954 LOC100363491 pseudo 7 18265620 18267159 6502137 LOC100909756 pseudo 11 41598397 41599650 7593720 LOC102552786 ncrna 5 145286537 145289357 7749952 LOC102553648 pseudo PNT010001321.1 667820 693375 9458718 LOC103694541 pseudo Y 154976 155408 9387204 LOC103694542 pseudo Y 1457690 1459324 9219087 LOC103694592 pseudo PNT010001132.1 2187264 2187980 9336450 LOC103694617 pseudo PNT010000023.1 661345 662906 9349187 LOC103694618 pseudo PNT010001132.1 1123831 1175904 9114443 LOC103694619 pseudo PNT010001132.1 1931185 1953681 9116785 LOC103694620 pseudo PNT010001132.1 2245912 2246597 9190354 LOC103694621 pseudo PNT010001132.1 2458510 2465224 9286744 LOC103694623 pseudo PNT010001708.1 237013 237585 9145806 LOC103694625 pseudo PNT010001708.1 521439 522180 9106138 LOC103694626 pseudo PNT010001708.1 1007525 1010971 9360924 LOC103694633 pseudo Y 13575973 13576334 9413074 LOC103694634 pseudo Y 12534816 12616245 9253668 LOC103694638 pseudo PNT010002086.1 9482 10090 9377320 LOC103694639 pseudo PNT010000689.1 481583 482232 9081311 LOC103694641 pseudo PNT010001244.1 640607 641186 9196178 LOC103694650 pseudo PNT010001321.1 918533 925293 9259842 LOC103694654 pseudo PNT010001409.1 608026 612979 9239463 LOC103694657 pseudo Y 10244746 10245346 9082366 LOC103694658 pseudo Y 10206770 10207344 9200706 LOC103694659 pseudo Y 10095537 10096203 9111334 LOC103694660 pseudo Y 10048099 10048681 9467586 LOC103694661 pseudo Y 9926359 9926940 9386929 LOC103694662 pseudo Y 9822558 9823128 9418532 LOC103694663 pseudo Y 9706130 9706712 9177843 LOC103694664 pseudo Y 9549440 9552485 9373736 LOC103694665 pseudo Y 9541043 9552684 9370619 LOC103694666 pseudo Y 8630131 8630454 9191027 LOC103694667 pseudo Y 10185706 10194422 9466631 LOC103694668 pseudo Y 10122764 10126162 9089891 LOC103694670 pseudo Y 9484414 9489463 9424984 LOC103694674 pseudo Y 7810590 7812041 9129716 LOC103694675 pseudo Y 7245572 7302702 9450419 LOC103694685 pseudo PNT010001132.1 4137660 4138726 9191690 LOC103694686 pseudo PNT010001132.1 3927207 3928328 9161808 LOC103694687 pseudo PNT010001132.1 3630268 3634664 9419577 LOC103694688 pseudo PNT010001132.1 3342427 3346808 9111335 LOC103694691 pseudo Y 10650773 10651283 9072288 LOC103694692 pseudo Y 10528897 10529572 9245671 LOC103694698 pseudo Y 21094631 21095021 9155763 LOC103694700 pseudo PNT010000024.1 1153509 1154306 9133778 LOC103694701 pseudo PNT010000024.1 607083 624286 9217353 LOC103694702 pseudo PNT010000024.1 360709 381122 9162768 LOC103694703 pseudo PNT010000024.1 207880 208576 9478556 LOC103694707 pseudo PNT010000356.1 1076389 1078263 9356380 LOC103694710 pseudo PNT010000356.1 448244 448822 9194639 LOC103694711 pseudo PNT010000356.1 323127 323697 9277141 LOC103694712 pseudo PNT010001486.1 3556549 3557130 9337306 LOC103694713 pseudo PNT010001486.1 3521930 3522649 9272286 LOC103694714 pseudo PNT010001486.1 3233718 3234300 9416133 LOC103694715 pseudo PNT010001486.1 3080511 3081078 9265619 LOC103694716 pseudo PNT010001486.1 2953907 2954626 9250052 LOC103694717 pseudo PNT010001486.1 2919462 2920043 9472673 LOC103694718 pseudo PNT010001486.1 2794207 2794788 9368714 LOC103694720 pseudo PNT010001486.1 2653670 2654237 9287861 LOC103694721 pseudo PNT010001897.1 170537 171112 9288464 LOC103694722 pseudo PNT010001897.1 116723 117335 9336705 LOC103694724 pseudo PNT010001435.1 9928 10487 9108352 LOC103694727 pseudo PNT010001486.1 2612840 2613415 9150420 LOC103694728 pseudo PNT010001486.1 2559010 2559619 9463308 LOC103694729 pseudo PNT010000356.1 210766 235151 9346467 LOC103694732 pseudo PNT010001486.1 3152021 3152661 9076422 LOC103694734 pseudo PNT010001486.1 2998935 2999514 9345061 LOC103694735 pseudo PNT010001486.1 2694157 2695677 9348297 LOC103694738 pseudo PNT010001486.1 2062838 2063463 9281544 LOC103694739 pseudo PNT010001486.1 1959067 1974183 9295130 LOC103694742 pseudo Y 5909764 5915420 9320684 LOC103694743 pseudo PNT010001486.1 1561336 1561922 9201192 LOC103694744 pseudo PNT010001486.1 1434151 1434910 9215816 LOC103694746 pseudo PNT010001486.1 747839 748554 9395586 LOC103694748 pseudo PNT010001486.1 1131388 1132096 9162396 LOC103694756 pseudo Y 22665295 22705240 9118337 LOC103694757 pseudo Y 23269345 23276071 9308985 LOC103694772 pseudo PNT010000023.1 2831262 2859231 9180728 LOC103694773 pseudo PNT010000023.1 6148652 6153081 9153016 LOC103694774 pseudo PNT010000023.1 6677188 6690866 9253669 LOC103694777 pseudo PNT010000023.1 7766641 7775772 9150680 LOC103694778 pseudo PNT010000023.1 8436008 8437569 9149207 LOC103694785 pseudo Y 24989717 24990102 9412153 LOC103694789 pseudo Y 27890455 27904707 9430201 LOC103694792 pseudo Y 28663961 28664284 9384967 LOC103694794 pseudo Y 29050730 29057430 9126098 LOC103694796 pseudo Y 15243290 15245098 9425156 LOC103694801 pseudo Y 17656581 17659021 9338889 LOC103694803 pseudo Y 18319474 18333895 9280433 LOC103694809 pseudo Y 26425273 26432090 9157418 LOC103694813 pseudo Y 28651057 28655436 9215300 LOC103694817 pseudo Y 30783064 30789653 11360501 LOC108348293 protein-coding 19 14443225 14453354 11464773 LOC108353322 pseudo PNT010001708.1 1187492 1187834 11474193 LOC108353323 pseudo PNT010001708.1 1230601 1244685 11358117 LOC108353328 pseudo PNT010000135.1 902050 902632 11440669 LOC108353335 pseudo Y 12183361 12183831 11468437 LOC108353358 pseudo PNT010000024.1 932870 933451 11510656 LOC108353368 pseudo PNT010000356.1 1208406 1208760 11408724 LOC108353369 pseudo PNT010000356.1 1169944 1170286 11447252 LOC108353371 pseudo PNT010001464.1 343019 343678 11388096 LOC108353375 pseudo PNT010000356.1 1256603 1257262 11501384 LOC108353377 pseudo Y 6022919 6023272 11427724 LOC108353378 pseudo Y 6908456 6910942 11459323 LOC108353380 pseudo Y 22777065 22779178 11427874 LOC108353390 pseudo PNT010000023.1 7985536 7986188 11426390 LOC108353395 pseudo Y 14409475 14409941 11501385 LOC108353396 pseudo Y 14860239 14860868 11498524 LOC108353398 pseudo Y 15190697 15191024 11485637 LOC108353400 pseudo Y 18615348 18615691 11477274 LOC108353404 pseudo Y 27279251 27284462 11386295 LOC108353405 pseudo Y 27438615 27438959 11406284 LOC108353411 pseudo Y 16241443 16241770 126928215 LOC121529648 pseudo 17 23780886 23781564 127284715 LOC121627837 pseudo 3 172012196 172012806 151664697 LOC124459649 protein-coding 4 169749438 169766867 727924 LOC257642 protein-coding PNT010000335.1 1 378 708503 LOC259245 protein-coding 5 77301267 77304588 708506 LOC259246 protein-coding 5 77326989 77330414 1598259 LOC366683 pseudo 6 99934779 99935983 1597099 LOC366715 pseudo 6 120622435 120624688 1587272 LOC367572 pseudo 1 37027055 37027920 1593573 LOC688090 protein-coding 20 5350270 5355317 2322953 Ly6k protein-coding 7 108441875 108444593 3062 Mcpt1 protein-coding 15 31445469 31448023 1302938 Mcpt8l2 protein-coding 15 31594221 31597174 1560404 MGC116197 protein-coding 9 4015880 4023989 14398587 Mir466b-1 ncrna 17 71513965 71514050 14398573 Mir466b-2 ncrna 17 71510953 71511034 14398574 Mir6317-1 ncrna 1 247534670 247534796 1594331 Mpp1 protein-coding Y 2135600 2144211 3119 Mt1-ps2 pseudo 2 50398741 50399130 1333135 Olr1649-ps pseudo 3 1822696 1823132 1332803 Olr1760-ps pseudo Y 19831331 19832079 1333759 Olr1769-ps pseudo PNT010000023.1 9066753 9067348 1334010 Olr1770-ps pseudo PNT010001842.1 86229 86890 1334202 Olr1772-ps pseudo 11 1340246 1340536 1334199 Olr1788-ps pseudo 3 3473217 3473609 1333446 Olr1815-ps pseudo 3 2543533 2544160 1333683 Olr1819-ps pseudo 3 4581663 4581836 1334268 Olr1821-ps pseudo 3 870667 871104 1333799 Olr1826-ps pseudo Y 21980425 21980968 1333003 Olr1827-ps pseudo Y 21386552 21386674 1333298 Olr1828-ps pseudo PNT010001132.1 3889123 3889600 1333648 Olr1829-ps pseudo Y 22929565 22930370 1332653 Olr1832-ps pseudo PNT010000023.1 2233293 2233746 1332838 Olr1842-ps pseudo 3 2809968 2810606 1333208 Olr1843-ps pseudo 11 922369 923042 1334223 Olr1844-ps pseudo PNT010001022.1 449227 449975 1332861 Olr1847-ps pseudo 3 2346670 2347508 1333919 Olr1848-ps pseudo 3 2340756 2341118 1334250 Olr1852-ps pseudo 11 308164 308801 1333968 Olr1863-ps pseudo 3 2137267 2137905 1333855 Or10al21-ps1 pseudo 3 1283985 1284623 1334066 Or10al31-ps1 pseudo PNT010000023.1 9196109 9196494 1333187 Or10al34-ps1 pseudo PNT010001132.1 5304644 5305281 1332663 Or10ap1-ps1 pseudo PNT010001022.1 347536 347997 1333524 Or10av1-ps1 pseudo 3 2263684 2264321 1332694 Or10aw1-ps1 pseudo 3 999967 1000606 1333718 Or10ax1-ps1 pseudo 11 2266453 2267071 1333939 Or10ax2-ps1 pseudo 3 1325469 1326087 1333727 Or10ba3-ps1 pseudo 11 1521976 1522613 1333046 Or8h7b protein-coding 3 75285852 75286799 1333112 Or8i10-ps1 pseudo 3 3601295 3601933 2427 Prl3d1 protein-coding 17 37703388 37709319 1597052 Rcrg1-ps23 pseudo 20 2130685 2130975 1309362 RGD1309362 protein-coding 18 55781101 55790008 1561230 RGD1561230 protein-coding X 91594718 91596795 5687330 Rn18s rrna PNT010000030.1 2423 4294 5687329 Rn28s rrna PNT010000046.1 1685 6487 5687331 Rn5-8s rrna 3 1649 1804 2319947 Rpl37a protein-coding 9 82753983 82756087 6490353 Seh1l protein-coding 18 63417593 63440513 1359570 Spetex-2A protein-coding 15 5363934 5367145 1359347 Spetex-2B protein-coding PNT010001256.1 3581 6731 1359263 Spetex-2D protein-coding 15 5437968 5440236 1359560 Spetex-2H protein-coding PNT010001599.1 1371 2152 1359560 Spetex-2H protein-coding PNT010000782.1 204 1209 1586419 Tgfbr3l protein-coding 12 3248837 3252293 1593643 Thap2 protein-coding 7 52899683 52914352 11455920 Thpol1 protein-coding 11 88905624 88910879 1584080 Trub2-ps2 pseudo 11 41566254 41567369 3912 Tspy1 protein-coding Y 1585543 1588858 1590535 Vbp1 protein-coding Y 2110980 2128847 1626206 Vom2r-ps132 pseudo 14 770710 771162 1626037 Vom2r-ps36 pseudo 1 68935802 68954063 1597225 Vom2r-ps87 pseudo 7 2023317 2024227 1626053 Vom2r-ps9 pseudo PNT010000246.1 666061 666944 1594671 Vom2r13 protein-coding 1 67297934 67328293 1561757 Vom2r2 protein-coding PNT010000246.1 891303 898474 1561322 Vom2r41 protein-coding 1 147158680 147206670 1592357 Vom2r65 protein-coding PNT010000246.1 391505 403912 1594209 Zfp874b protein-coding 1 34840401 34850612